目前，国内外心理疗法众多，主要以精神分析疗法与认知行为疗法为主，精神分析疗法的治疗要深入到心理结构的最底层——潜意识的层面分析冲突。伍君仪在广州日报上发表的《瞎分析，不如纠正认知》一文中指出，精神分析疗法由于缺乏理论依据，疗效缺乏证据，备受质疑，在国际上逐渐边缘化，取而代之的是认知行为疗法（英文缩写CBT）。国外大量研究证明CBT的疗效良好。如CBT对抑郁症有良好的治疗效果。宾夕法尼亚大学研究发现，抑郁患者经过12周CBT后，80％的人有显著改善，随访一年，疗效稳定。爱丁堡大学、哥伦比亚大学和匹兹堡大学的研究组也证实CBT的疗效，研究结果还显示，CBT对于精神病性抑郁的病人效果较差。
为什么CBT治愈精神性抑郁的病人效果不佳呢？本心疗法创始人张功和老师认为这是由于CBT对心理疾病的归因不合理所致。CBT认为心理疾病由不合理的信念所致，主要有过度概括化、糟糕至极、绝对化三个不合理的信念。张功和老师经过多年的咨询，发现不自由想法的积累是心理障碍的发病机制。心理问题的产生由不自由想法引起。CBT中的不合理的信念是不自由想法的表现形式之一，即不自由想法是心理问题产生的根，不合理信念只是叶。CBT认为人的情绪是跟人的想法有关，只要改变想法就可以产生新的情绪体验，从而改善负面情绪。张老师认为，其目的终究是为了快速消除症状，消除情绪信号，表面上，好像是找到了病因并对病因进行处理，实际上，原来产生情绪的不自由的想法并没有从情绪的信号作用中挖掘出来，也没有从记忆中消失，只是自动进入潜意识中，似乎不再起作用，但这样是不是把危险藏得更深了呢？因在精神世界里，不自由的想法还是存在，当新建立起来的认知不再发挥作用时，心理精神疾病依然会再次爆发。如抑郁症患者总认为自己不被人爱，很没用，按CBT的做法就是想办法引导患者改变原有的认知，不再认为自己不被人爱，不再是累赘，从而起到改善抑郁情绪的作用。但当患者以后意识到自己不被人爱，很没用时，内心将会更加痛苦。张功和老师认为，这就是CBT治愈精神性抑郁的病人效果不佳的原因。
本心疗法认为，不自由想法是指个体在成长的过程中吸收了大量似是而非却没有自我消化，最终产生心理问题的想法，当这些想法出现在意识层面时，就会引起身体的紧张，即心理烦恼。这都是因为没有学会理性思考所致。因此解决心理问题的对策就是学会理性思考，重新思考并定义那些不自由的想法。如某一来访者认为自己没用，一旦生活事件促使他出现我没用（不自由想法）的想法时，他便极其紧张与痛苦。张老师便询问他：“你对没用的定义是什么？为什么说自己没用呢？没用有什么不好？”。当唤起来访者对这些不自由想法的重新思考后，他便形成了没用的自我定义，当他再次出现我没用这个想法时，他不会再焦虑不安而是平静地理性思考如何变得有用的方法。
本心疗法认为，思考分为理性思考与非理性思考。理性思考是指个体的想法对个体的生物机体本身不发生作用，内心平静，情绪为零。此时，想法不带情绪，是心灵自由的状态。感性思考是指想法本身会对个体的生物机体产生作用，导致情绪，即机体由放松的平衡状态转变为紧张的不平衡的受力状态。此时，想法带有情绪，是心灵不自由的状态。如有的人一紧张就脸红耳赤与头痛胸闷，这就是情绪，即身体的紧张。本心疗法还认为，情绪即心理烦恼。
本心疗法的咨询目标是帮助来访者恢复心灵自由，真正做回自己。人初到世上，能够真正做自己，做到身心合一。但在社会化的过程中，我们开始有了思想，有了很多没有经过自己的思考仅仅是被记住的想法，且这些想法不一定适合你，表现为当这些想法出现在你的意识中时，你的身体会紧张，产生大量负面情绪。因为身体是心灵世界的载体，就犹如人吃了东西没有消化就进入肠道，人就易生病。同样因我们没有消化这些想法，成了心灵世界的异物，心理疾病由此而生。心灵世界的消化功能就是人的思维能力-思考。心理咨询就是协助你去理性思考，消化那些本不属于你的想法，就像牛把吃进肚子里的草倒出来再咀嚼一遍，你要真正加以消化那些不自由的想法，让你的心灵世界回归到本来的、心灵自由的状态，身心合一，治标治本。
张功和老师通过十多年临床实践与经验的总结，证明该疗法确实治标治本。张老师认为，真正彻底有效的心理咨询是指专业的咨询师暂时用来访者的眼光看来访者的世界，通过问话技术把心理学规律嵌入来访者的思维模式中，促使其学会理性思考，把复杂的人变为简单的人，由模糊变清晰，让来访者的心灵去掉羁绊，恢复自由，这才是真正的治愈。因此，一切以消除症状、消除情绪信号为最终目的的治疗手段，都是治标不治本，病因不除，病根还在，极易复发。只有找到并解决真正的病因，症状自然消失，没有必要对症状进行治疗。症状只是一件外衣，形式多变，从某一症状出发很难找到规律与共性。
本心疗法易学习与被复制。本心疗法因悟通了心理学规律，因而容易被学习、被复制、被推广，让人人受益。自2009年本心研究会成立以来，至今已招募8期本心疗法学员，在教与学的过程中，本心疗法实现了创新性发展，更理论化与系统化，更便于今后学员的学习与传播。心理规律很简单，心理现象很复杂，我们只有悟通了简单的心理规律才能应对复杂多样的心理现象，以不变应万变。本心疗法能够促使咨询师们快速、全面、彻底地清理自己内心的污泥，把痛苦分子（不自由想法）一粒一粒捞出来，使其心灵更加自由，趋近一种无限包容的“空”的境界，成为一面明亮干净的镜子，清晰地照出来访者心灵世界的模样。唯有如此，才能更系统、更快速地引导来访者全面又彻底地掌握心理学规律，学会思考，恢复心灵自由。
